В составе Института ИБС работают две базовые кафедры: кафедра информационных бизнес систем и кафедра систем автоматизации управления производством.
Институт реализует программу специализированной магистерской подготовки "Консалтинг в области внедрения корпоративных информационных систем на базе SAP и Oracle" в рамках направления 080800 – "Прикладная информатика".
Подготовка магистров осуществляется по заказу компании ООО "Информационные бизнес системы" (IBS), занимающей лидирующие позиции в России в сфере информационных технологий и IT-консалтинга.
На магистерскую программу принимаются все желающие, имеющие уровень образования не ниже бакалавра (бакалавры, специалисты, магистры), успешно прошедшие вступительные испытания.